Dans le contexte du développement durable, l’analyse du cycle de vie (ACV) est l’outil indispensable pour évaluer les impacts des systèmes de production. Lorsque ceux-ci incluent des processus multifonctionnels, la problématique d’allocation des impacts se présente. Plusieurs approches ont été introduites, chacune aboutissant à des résultats différents. Une question majeure à laquelle les experts sont confrontés est le choix de la méthode d’allocation. La revue de littérature réalisée a permis d’identifier les principales méthodes. Une analyse croisée a révélé un fort lien entre le choix de la méthode d’allocation et les objectifs des décideurs. Par conséquent, cet article propose un outil pour orienter ce choix. Le premier niveau identifie le contexte, puis plusieurs questions mènent à la méthode d’allocation convenable. L’outil a été testé sur deux études ACV impliquant des co-produits: les pommes détériorées et la paille. L’outil a été validé et discuté avec les directives de l’ISO 14044: 2006